Caracterización de aislamientos de Klebsiella pneumoniae doble productores de carbapenemasas en un hospital universitario / Phenotypic and genotypic characterization of double carbapenemase producing Klebsiella pneumoniaeisolates in a University Hospital

La emergencia de aislamientos de Klebsiella pneumoniaedoble productores de carbapenemasas (KPC y NDM) es una de las consecuencias de la pandemia causada por SARS-CoV-2 que ha causado un impacto significativo en las tasas de resistencia a los antimicrobianos en las infecciones intrahospitalarias por esta enterobacteria. Estos aislamientos representan un desafío para los servicios de salud, por su detección y caracterización y posterior tratamiento. En este trabajo se describen los aislamientos portadores de KPC y NDM recuperados durante 2022 aislados de distintas muestras clínicas de pacientes internados en un hospital universitario de la Ciudad de Buenos Aires, se los caracteriza fenotípicamente y genotípicamente como portadores de ambas carbapenemasas y se destaca la excelente actividad in vitro de la combinación ceftazidima-avibactam y aztreonam en el tratamiento de estas infecciones en donde las alternativas terapéuticas estarían limitadas a antibióticos no ß-lactámicos con porcentajes de resistencia que superan el 70%

The emergence of double-carbapenemase (KPC and NDM) producing Klebsiella pneumoniae isolates is one of the consequences derived from the SARS CoV-2 pandemic, which has caused significant impact on the antimicrobial resistance rates in hospital acquired infections. These isolates represent a real challenge for Health Services due to their difficult detection and characterization and subsequent treatment. In the present work we describe the double carbapenemase producing isolates recovered during the year 2022 from clinical samples belonging to hospitalized patients at a University Hospital in Buenos Aires city, we report their phenotypic and genotypic characterization and the excellent "in vitro" activity of the ceftazidime-avibactam-aztreonam combination in the treatment of infections in which the therapeutical options are restricted to non ß- lactamic antimicrobials which hold resistance rates higher than 70%

First nosocomial outbreak of SME-4-producing Serratia marcescens in South America / Primer brote nosocomial por Serratia marcescens productora de SME-4en Sudamérica

Abstract Carbapenemase-producing-Serratia marcescens isolates, although infrequent, are considered important nosocomial pathogens due to their intrinsic resistance to polymyxins, which limits therapeutic options. We describe a nosocomial outbreak of SME-4-producing S. marcescens in Buenos Aires city which, in our knowledge, represents the first one in South America.

Resumen Los aislamientos de origen nosocomial de Serratia marcescens productores de car-bapenemasa, si bien son infrecuentes, son considerados importantes patógenos debido a su resistencia intrínseca a las polimixinas, lo cual limita aún más las opciones terapéuticas. En este trabajo se describe un brote nosocomial causado por S. marcescens portadora de car-bapenemasa de tipo SME-4 en la Ciudad de Buenos Aires, el cual representaría el primero en Sudamérica.

Epidemiología molecular de aislados de Acinetobacter baumannii resistentes a carbapenems en Argentina / Molecular epidemiology of carbapenem-resistant isolates of Acinetobacter baumannii in Argentina

Se estudiaron 100 aislados consecutivos y no epidemiológicamente relacionados de Acinetobacter baumannii resistentes a los carbapenems, recuperados entre enero y agosto de 2016 de muestras clínicas en 11 hospitales de 10 provincias de la Argentina, ubicadas en distintas regiones del país. Los genes que codifican las carbapenemasas de Ambler clase D y clase B se investigaron mediante la técnica de PCR utilizando cebadores específicos. Todos los aislados se agruparon mediante las técnicas de 3-locus sequence typing y la secuenciación del gen blaOXA-51-like. El gen blaOXA-23 se recuperó en todos los aislados estudiados. La población de A. baumannii resistente a carbapenems en Argentina estuvo asociada, principalmente, con ST1 (45%), ST25 (34%) y ST79 (15%). ST25 se recuperó en todas las regiones estudiadas y no se detectó CC2.

One hundred sequential, epidemiologically unrelated carbapenem-resistant- Acinetobacter baumannii isolates from 11 hospitals in 10 Argentine provinces were collected between January and August 2016. Genes coding for Ambler class D and B carbapenemases were investigated by PCR using specific primers. All isolates were typed using the 3-locus sequence typing and b/aOXA-51-like sequence-based typing techniques. The blaOXA-23 gene was recovered in all isolates studied. The population of carbapenem-resistant- A. baumannii in Argentina was principally associated with ST1 (45%), ST25 (34%) and ST79 (15%). ST25 was recovered in all the regions studied and CC2 was not detected.

Escenario actual de la resistencia a la colistina mediada por plásmidos en América Latina / Current scenario of plasmid-mediated colistin resistance in Latin America

Colistin resistance can occur by chromosomal mutations and by acquisition of plasmid-carrying determinants, mainly mcr-1. In the recent years, we have observed the out-burst of this resistance gene in our region. Due to the risk of the rapid dissemination of mcr-1, this finding has worried and alerted different actors from the health field and has become one of the most prolific topics. Our review compiles available reports of well-documented mcr-1-positive strains of Enterobacteriaceae, obtained from different samples in Argentina and other countries of Latin America. Furthermore, it addresses the association of mcr-1 with ESBL resistance markers and outlines the platforms involved in their dissemination.

La resistencia a la colistina puede ocurrir por mutaciones cromosómicas o por la adquisición de determinantes localizados en plásmidos, el principal es mcr-1. En los últimos años hemos observado la explosiva aparición de este gen de resistencia en nuestra región. Debido al riesgo que implica la rápida diseminación de mcr-1, este hallazgo ha preocupado y alertado a los diferentes actores del área de la salud, y se ha convertido en uno de los temas de investigación más importantes. La presente revisión compila los informes de aislamientos portadores de mcr-1 debidamente documentados en Enterobacteriaceae, obtenidos de diferentes muestras en Argentina y otros países de América Latina. Además, aborda la asociación de mcr-1 con otros marcadores de resistencia, como las BLEE, y describe las plataformas involucradas en su diseminación.

Carbapenemases in Acinetobacter baumannii: Review of their dissemination in Latin America / Carbapenemasas en Acinetobacter baumannii: Revisión de su diseminación en América Latina

Carbapenem resistance in gram-negative bacteria by production of carbapenemases is one of the most challenging issues regarding healthcare worldwide. We review the epidemiology and prevalence of carbapenemases in carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii isolates from Latin American countries. High resistance rates to antimicrobial agents, particularly to carbapenems, are observed in this region. OXA-23 is the most widely disseminated class D-carbapenemase; it is present in all the countries of the region and is frequently associated to endemic clones CC113/CC79, CC104/CC15, CC110/ST25 and CC109/CC1. The emergence of OXA-72 and NDM-1 represents a novel finding which is observed simultaneously and without clonal relatedness in different countries, some of which are distant from one another, whereas OXA-143 is only present in Brazil. Further collaborative intraregional studies would provide a better understanding of these issues in most of the countries and thus, policies to control the spread of these isolates could be implemented.

En bacilos gram negativos, la resistencia a carbapenemes por producción de carbapenemasas es uno de los mayores problemas en la atención de la salud a nivel mundial. Reseñamos en este artículo la epidemiologia y la prevalencia de las carbapenemasas descritas en aislamientos de Acinetobacter baumannii recuperados en América Latina. En esta región se ha observado un alto porcentaje de resistencia a los antimicrobianos, particularmente a los carbapenemes. La carbapenemasa más frecuentemente descrita es OXA-23, que ha sido recuperada en todos los países de la región y fue asociada a los clones endémicos CC113/CC79, CC104/CC15, CC110/ST25 y CC109/CC1. La emergencia de OXA-72 y NDM-1 representa un nuevo hallazgo en varios países, algunos de los cuales se encuentran muy distantes entre sí. Por el momento, OXA-143 solo se recuperó de aislamientos obtenidos en Brasil. Serían necesarios estudios colaborativos dentro de la región para lograr una mejor comprensión de la resistencia a carbapenemes en Acinetobacter baumannii, a fin de poder instaurar medidas de control que eviten una mayor diseminación de esta bacteria.

Enterobacterias portadoras de KPC en un hospital universitario / KPC-producing Enterobacteriaceae in a university hospital

La resistencia a carbapenemes en enterobacterias representa una situación de alto impacto clínico debido a las limitadas opciones terapéuticas disponibles para el tratamiento de las infecciones causadas por estos microorganismos multirresistentes que cursan con altas tasas de morbilidad y mortalidad. En nuestro país, en los últimos 5 años, se observó la diseminación de aislamientos de Klebsiella pneumoniae portadores de carbapenemasa de tipo KPC pertenecientes al ST258, clon diseminado mundialmente. En nuestro hospital la incidencia de episodios fue aumentando, especialmente la infección del sitio quirúrgico y las bacteriemias. En el último bienio se observó la diseminación del mecanismo de resistencia a otras enterobacterias y probablemente a otros secuenciotipos de K pneumoniae con mayor sensibilidad a antibióticos no ß-lactámicos. Se hace necesario instaurar las correctas medidas de prevención y control para evitar la diseminación de estos patógenos.

The presence of carbapenem -resistant Enterobacteriaceae in clinical settings represents a concerning issue due to the limited therapeutic options available for the treatment of the infections caused by these multi-drug resistant bacteria which usually have high mortality rates. The spread of Klebsiella pneumoniae isolates belonging to ST258 was observed in the last 5 years in our country. In our hospital the number of episodes has grown with the years and the most prevalent infections were the surgical site and bacteremia. In the last 2 years KPC spread to other Enterobacteriaceae and probably to other STs in K pneumoniae which showed different susceptibility patterns to non ß-lactamic antimicrobials. We believe that it is vital to install the appropriate measures to prevent and control the dissemination of these microorganisms.

Actividad in vitro de ampicilina-ceftriaxona frente a aislamientos de Enterococcus faecalis recuperados de infecciones invasivas / In vitro activity of ampicillin-ceftriaxone against Enterococcus faecalis isolates recovered from invasive infections

Se evaluó la actividad in vitro de la asociación entre ampicilina y ceftriaxona frente a 30 aislamientos de Enterococcus faecalis obtenidos de infecciones invasivas de pacientes atendidos en el Hospital de Clínicas José de San Martín, Ciudad Autónoma de Buenos Aires. Las sinergias entre ampicilina y ceftriaxona se determinaron mediante la técnica de dilución en caldo Müeller-Hinton con el agregado de diferentes concentraciones subinhibitorias de ceftriaxona o sin este. La asociación fue sinérgica en 22/30 aislamientos. En 14/30 aislamientos la asociación disminuyó los valores de concentración inhibitoria mínima (CIM) y de concentración bactericida mínima (CBM); en 6/30 se observó solamente una disminución de la CIM, mientras que en 2 solo se determinó una reducción de la CBM. La actividad bactericida de la asociación fue mayor a bajas concentraciones de ampicilina (menor de 1µg/ml). Se demostró la sinergia in vitro entre ampicilina-ceftriaxona; se confirmó así la utilidad de esta asociación en el tratamiento de infecciones severas causadas por E. faecalis

In vitro activity of the combination of ampicillin- ceftriaxone against 30 Enterococcus faecalis isolates recovered from invasive infections in patients admitted to Hospital de Clínicas José de San Martin in the city of Buenos Aires was assessed. Ampicillin- ceftriaxone synergies were determined by microdilution in Müeller-Hinton (MH) broth with and without subinhibitory concentrations of ceftriaxone. Synergy was detected in 22/30 isolates. A decrease in both minimum inhibitory concentration (MIC) and minimum bactericidal concentration (MBC) was observed in 14/30 isolates, whereas in 6/30 isolates the decrease was observed in the MIC value and only in the MBC value in the 2 remaining isolates. The bactericidal activity of the combination showed to be higher at low concentrations of ampicillin (< 1µg/ml). We detected in vitro synergy using the ampicillin-ceftriaxone combination and thus, its efficacy was confirmed in the treatment of severe infections by E. faecalis

Frecuencia de aislamiento y resistencia a los antimicrobianos de Acinetobacter spp. recuperadas de pacientes atendidos en un hospital universitario de la Ciudad Autónoma de Buenos Aires / Frequency and antimicrobial resistance of Acinetobacter species in a university hospital of Buenos Aires city

Se analizaron 200 aislamientos de Acinetobacter correspondientes a igual cantidad de pacientes atendidos en el Hospital de Clínicas José de San Martín entre marzo de 2013 y junio de 2014. La identificación se realizó mediante espectrometría de masa y se confirmó con métodos moleculares. La sensibilidad a los antimicrobianos se determinó mediante el sistema Vitek-2. La correlación entre la identificación obtenida con la espectrometría de masa y las técnicas moleculares fue del 94 %. Acinetobacter baumannii multirresistente fue la genoespecie predominante (92,6 %) en la infección intrahospitalaria, y la frecuencia de aislamiento de Acinetobacter pitti y de Acinetobacter nosocomialis fue de 3,5 % y 0,5 %, respectivamente. En la infección extrahospitalaria se observó una mayor presencia de otras genoespecies. Acinetobacter johnsonii y A. baumannii fueron las más frecuentes y juntas representaron el 45,9 % de los hallazgos. La resistencia a carbapenems y a minociclina solo se observó en A. baumannii. La espectrometría de masa resultó ser una herramienta útil en la identificación de las diferentes genoespecies

Two-hundred Acinetobacter isolates belonging to 200 patients admitted to Hospital de Clínicas José de San Martín during the period March 2013-June 2014 were analyzed. The identification was performed by mass spectrometry and was confirmed by molecular methods. Susceptibility to antimicrobials was studied by the Vitek-2 system. A 94% correlation of both identification methods was found. Multidrug resistant Acinetobacter baumannii was the predominant genomic species (92.6%) in hospital-acquired infections, whereas Acinetobacter pitti and Acinetobacter nosocomialis accounted for 3.5% and 0.5% of the isolates recovered, respectively. In community-acquired infections a major predominance of the different genomic species was observed. Acinetobacter johnsonii and A. baumannii are the most frequent species, accounting for 45.9% of the isolates recovered. Resistance to carbapenems and minocycline was only observed in A. baumannii. Mass spectrophotometry was an effective tool for the identification of the different genomic species

Emergencia de la resistencia a colistina en Klebsiella pneumoniae. Caracterización microbiológica y epidemiológica de aislamientos productores y no productores de carbapenemasa de tipo KPC / [Emergence of colistin-resistant Klebsiella pneumoniae. Microbiological and epidemiological characterization of the isolates producing and non-producing KPC-type carbapenemase].

Sixty-four colistin-resistant Klebsiella pneumoniae isolates recovered from clinical specimens from 57 patients admitted to Hospital de Clinicas Jose de San Martin during the period 2010-2012 were studied to describe the microbiological and epidemiological characteristics and factors associated with the emergence of colistin-resistance. Fifty-four colistin-susceptible K. pneumoniae isolates from the same period were also included in the study. The genetic relatedness among the isolates was studied by a PCR assay. Fifty percent of the resistant isolates were KPC-2 producers, 45.3

were ESBL producers and 4.7

only showed resistance to aminopenicilins. All KPC-producers (resistant and susceptible to colistin) were genotipically indistinguishable except for one, whereas the presence of 7 clonal types, which were different from the ones identified in the colistin-susceptible isolates, were detected among ESBL producers. The previous use of colistin was the main factor associated with the acquisition of resistance, and in the case of non-KPC producers the stay in ICU was another significant factor observed. Colistin resistance emerged in our hospital in the year 2010, reaching 3

in nosocomial isolates and maintaining this rate in successive years, due to the selection of resistant subpopulations in the epidemic clonal type in KPC-producers and due to the dispersion of colistin-resistant clonal types in non-KPC producing-isolates.

Enterococcus spp: Resistencia antimicrobiana en infecciones intrahospitalarias / Enterococcus spp: Antimicrobial resistance in hospital-acquired infections / Enterococcus spp: Resistência antimicrobiana em infecções intra-hospitalares

Entre los años 1996 y 2010 se estudiaron 1873 aislamientos de Enterococcus spp. pertenecientes a pacientes internados en un hospital universitario de la Ciudad Autónoma de Buenos Aires con infección intrahospitalaria. El 64,2% y el 30,4% de los aislamientos correspondieron a E. faecalis y E. faecium, respectivamente. En el periodo estudiado las infecciones por Enterococcus spp. representaron entre el 8% y el 10% del total de las infecciones nosocomiales. La prevalencia de E. faecium aumentó de un 1,5% en el año 1996 a un 4% en 2010. El primer aislamiento de enterococo resistente a vancomicina se detectó en el año 1998 y correspondió a un E. faecium y en el año 2004 se halló en E. faecalis. Actualmente más del 70% de los aislamientos de E. faecium son resistentes a vancomicina, no así en E. faecalis donde la resistencia es ocasional. No se detectó resistencia a linezolid ni a tigeciclina en Enterococcus spp.

Resistencia a cefalosporinas de espectro extendido en enterobacterias sin AmpC inducible: Evaluación de los nuevos puntos de corte / Resistance to extended-spectrum cephalosporins in non-inducible AmpC enterobacteria: Evaluation of the new MIC breakpoints

Los objetivos de este estudio fueron determinar la actividad in vitro de las cefalosporinas de espectro extendido frente a aislamientos clínicos de enterobacterias sin AmpC inducible y evaluar la utilidad de las normativas propuestas por el CLSI 2009 y de los puntos de corte recomendados por el CLSI 2010 y el EUCAST 2010. El análisis incluye la caracterización feno y genotípica de los mecanismos de resistencia. En todos los aislamientos se realizó un antibiograma semicuantitativo y se determinó la CIM por dilución en agar. Asimismo, se realizó la detección fenotípica de p-lactamasas de espectro extendido (BLEE), de AmpC plasmídica (AmpCp) y de carbapenemasas de tipo KPC. En los aislamientos que fueron resistentes a las cefalosporinas de espectro extendido (CEE) se evaluó, mediante PCR múltiple para b/aSHV y b/aCTX-M y PCR con cebadores específicos, el tipo de p-lactamasa pre-valente y la presencia de KPC. Se recuperaron de pacientes 169 aislamientos resistentes a CEE: 95 de K/ebsie//a pneumoniae, 55 de Escherichia co/i y 19 de Proteus mirabi/is. La resistencia a CEE se verificó en el 56,2 %; 32,6 % y 11,2 % de estos conjuntos de aislamientos, respectivamente. Se detectó el fenotipo BLEE en 152 aislamientos (90 %), el fenotipo AmpCp en 12 (7 %) y el KPC en 5 (3 %). Las recomendaciones del CLSI 2009 y los puntos de corte del CLSI 2010 y del EUCAST 2010 para la ceftriaxona permitieron detectar eficientemente las BLEE, mientras que para la ceftacidima, con los puntos de corte del CLSI 2010 solo se detectó el 55 % de las BLEE. Esta discrepancia en los porcentajes de resistencia a ceftriaxona y a ceftacidima se relaciona con la presencia de CTX-M en nuestro medio. Los nuevos puntos de corte detectaron con mayor eficiencia las enzimas de tipo AmpCp.

The aims of this study were to evaluate the in vitro activity of extended-spectrum cephalosporins (ESC) in non-inducible AmpC enterobacteria throµgh phenotypic and genotypic characterization of the mechanisms of resistance (ESBL, plasmid-mediated AmpC and KPC) and to evaluate the interpretation criteria proposed by the existing recommendations and the new breakpoints established by the CLSI and the EUCAST. Susceptibility tests and PCR multiplex for b/aSHV and b/aCTX-M and amplification using specific primers was performed. One hundred sixty nine resistant isolates: K/ebsie//a pneumoniae (95), Escherichia co/i (55), and Proteus mirabi/is (19) were recovered. ESC resistance was 56.2 %, 32.6%, and 11.2 %, respectively. ESBL was detected in 152 (90 %) isolates, plasmid-mediated AmpC in 12 (7 %) and KPC in 5 (3 %). The CLSI 2009 recommendations and the breakpoints sµggested by the CLSI 2010 and the EUCAST for ceftriaxone were efficacious to detect ESBL, whereas the different breakpoints for ceftazidime presented discrepancies. The CLSI 2010 breakpoints only detected 55 % of the ESBL-producing isolates due to the endemic presence of CTX-M ESBLs in our country. Regarding the plasmid-mediated AmpC producers, the recommendations of the CLSI 2010 and the EUCAST 2010 proved to be more efficient than the old ones.

Bacteriemias causadas por Acinetobacter spp. y resistencia a carbapenemes / Bacteremias by Acinetobacter spp. and carbapenems resistance

Se analizaron retrospectivamente las bacteriemias causadas por Acinetobacter spp. en pacientes internados en el Hospital de Clínicas José de San Martín, Universidad de Buenos Aires, entre enero de 2002 y junio de 2008. El porcentaje de bacteriemias resistente a los carbapenemes se elevó desde 50% en el año 2002 a 70% en los años 2007-2008. Los factores de riesgo estadísticamente significativos asociados con la adquisición de bacteriemias causadas por Acinetobacter spp. resistente a los carbapenemes son: tratamiento previo con carbapenemes (p<0,05), internación en la unidad de cuidados intensivos (p<0,05), y bacteriemias polimicrobianas (p<0,05). Colistin, minociclina y tigeciclina fueron activos frente a la totalidad de los aislamientos estudiados mientras que sulbactam, cefepime, amicacina, gentamicina y levofloxacina fueron más activos frente a los aislamientos sensibles a los carbapenemes.

The incidence, risk factors and susceptibility of Acinetobacter bacteremia in patients from Hospital de Clinicas, University of Buenos Aires, were retrospectively analysed. One hundred and one patients were evaluated between 2002 and 2008. An increasing resistance to carbapenem in bacteremia was observed, rising from 50% in 2002 to 70% in 2007-2008. Significative risk factors for the acquisition of imipenem resistance Acinetobacter bacteremia included: previous use of imipenem (p<0.05), intensive care units stay (p<0.05), and polimicrobial bloodstream (p<0.05). Minocycline, tigecycline and colistin were active in all strains whereas sulbactam, cefepime, amikacin, gentamicin and levofloxacin showed a better activity among imipenem-susceptible isolates.